Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc12Q8R344 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc12Q8R344 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms