Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K8

Uncharacterized protein C1orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R2K8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8R2K8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8R2K8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8R2K8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8R2K8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8R2K8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8R2K8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8R2K8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8R2K8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8R2K8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms