Protein–RNA interactions for Protein: Q8R296

Vmn1r237, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r237Q8R296 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vmn1r237Q8R296 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r237Q8R296 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms