Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg10Q8R1P4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg10Q8R1P4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms