Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f2Q8R0A0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms