Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sf3b4Q8QZY9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms