Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf183Q8QZS5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rnf183Q8QZS5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms