Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PolbQ8K409 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PolbQ8K409 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms