Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrrtm1Q8K377 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm1Q8K377 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms