Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Depp1Q8K2F3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms