Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcf3Q8K268 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Abcf3Q8K268 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms