Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Polr1eQ8K202 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Polr1eQ8K202 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms