Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmc2Q8K199 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cmc2Q8K199 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cmc2Q8K199 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Cmc2Q8K199 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmc2Q8K199 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms