Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt33aQ8K0Y2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt33aQ8K0Y2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms