Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Neurl3Q8CJC5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Neurl3Q8CJC5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms