Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Znf628Q8CJ78 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms