Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NgefQ8CHT1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NgefQ8CHT1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms