Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip3Q8CHD8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip3Q8CHD8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab11fip3Q8CHD8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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