Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Parp11Q8CFF0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Parp11Q8CFF0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms