Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN6

Txnl1, Thioredoxin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnl1Q8CDN6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Txnl1Q8CDN6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms