Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc87Q8CDL9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms