Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RybpQ8CCI5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms