Protein–RNA interactions for Protein: Q8C561

Lmbrd2, LMBR1 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd2Q8C561 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lmbrd2Q8C561 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lmbrd2Q8C561 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms