Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc90bQ8C3X2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc90bQ8C3X2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms