Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FarsaQ8C0C7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FarsaQ8C0C7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms