Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rccd1Q8BTU7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rccd1Q8BTU7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms