Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PcgF3Q8BTQ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms