Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gjd4Q8BSD4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjd4Q8BSD4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjd4Q8BSD4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjd4Q8BSD4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjd4Q8BSD4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjd4Q8BSD4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gjd4Q8BSD4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gjd4Q8BSD4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gjd4Q8BSD4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms