Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap4Q8BMK4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap4Q8BMK4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms