Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms