Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tspan12Q8BKT6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan12Q8BKT6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms