Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc5a7Q8BGY9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc5a7Q8BGY9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms