Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vipas39Q8BGQ1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vipas39Q8BGQ1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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