Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ubash3bQ8BGG7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubash3bQ8BGG7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms