Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y72

Cstl1, Cystatin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstl1Q80Y72 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstl1Q80Y72 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstl1Q80Y72 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstl1Q80Y72 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstl1Q80Y72 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstl1Q80Y72 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstl1Q80Y72 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstl1Q80Y72 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cstl1Q80Y72 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cstl1Q80Y72 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cstl1Q80Y72 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cstl1Q80Y72 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cstl1Q80Y72 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cstl1Q80Y72 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cstl1Q80Y72 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms