Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrfn4Q80XU8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrfn4Q80XU8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrfn4Q80XU8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Lrfn4Q80XU8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Lrfn4Q80XU8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrfn4Q80XU8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Lrfn4Q80XU8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Lrfn4Q80XU8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Lrfn4Q80XU8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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