Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vgll4Q80V24 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vgll4Q80V24 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms