Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rab3gap1Q80UJ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab3gap1Q80UJ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap1Q80UJ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap1Q80UJ7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap1Q80UJ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap1Q80UJ7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap1Q80UJ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap1Q80UJ7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms