Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Znf516Q7TSH3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Znf516Q7TSH3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms