Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf18Q7TS55 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf18Q7TS55 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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