Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ShprhQ7TPQ3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ShprhQ7TPQ3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ShprhQ7TPQ3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms