Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD1

Fbxo11, F-box only protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo11Q7TPD1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fbxo11Q7TPD1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxo11Q7TPD1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms