Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SyncripQ7TMK9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SyncripQ7TMK9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms