Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ScocQ78YZ6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ScocQ78YZ6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms