Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
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Mindy1Q76LS9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mindy1Q76LS9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mindy1Q76LS9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Mindy1Q76LS9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mindy1Q76LS9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mindy1Q76LS9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mindy1Q76LS9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mindy1Q76LS9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mindy1Q76LS9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms