Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NinlQ6ZQ12 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NinlQ6ZQ12 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms