Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pcp4l1Q6W8Q3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pcp4l1Q6W8Q3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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