Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cxcl3Q6W5C0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cxcl3Q6W5C0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms