Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc88cQ6VGS5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms