Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc57Q6PHN1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc57Q6PHN1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms